Incepand din anul 1963 au fost infiintate 17 arii protejate declarate parcuri naturale. Cele mai multe se afla in centrul si sud – vestul tarii, iar trei dintre cele mai frumoase si mai valoroase se afla pe teritoriul Moldovei.
Parcul Natural Putna – Vrancea – este situat in sectorul central nord – vestic al Muntilor Vrancei, acoperind bazinul hidrologic al raului Putna, dar si masivele Goru si Mordanu. Parcul cuprinde zone de protectie si conservare a faunei ( capra neagra, urs, lup si ras) si a florei ( arborele de tisa, jneapanul, floarea – reginei, papucul doamnei). Aici se gasesc Cheile Tisitei, succesiune de canioane sapate in formatiuni sedimentare, Cascada Putna, Groapa cu Pini, Stramtura – Coza, Padurea Lepsa – Zboina, toate acestea fiind incluse in reteaua ecologica Natura 2000.
Parcul Natural Lunca Joasa a Prutului Inferior, situat in Galati se afla pe sectorul a trei coridoare majoare de migratie a pasarilor care clocesc pe teritoriul Eurasiei: traseul East Elbic – pe raul Prut, traseul Carpatic – pe raul Siret si traseul Pontic – spre nordul continentului european. Parcul are o suprafata de 8247 ha si contine patru zone de conservare speciala, patru zone cu regim de rezervatie naturala, lunca Joasa a Prutului, Lacul Pochina, Lacul Vlascuta, Ostrovul Prut – 62 de hectare situate pe Dunare, in dreptul varsarii Prutului in fluviu. In zona au fost identificate 239 specii de pasari, dintre care 50 sunt incluse in Cartea Rosie a vertebratelor din Romania.
Parcul Natural Vanatori – Neamt – amplasat in partea nordica a judetului Neamt, pe versantul estic al Muntilor Stanisoarei, avand 30.818 hectare. Parcul cuprinde 4 arii protejate, printre care una dintre cele 4 rezervatii de zimbri din Romania „Dragos – Voda”, infiintata in anul 1968, fiind atractia cea mai vizitata din Moldova. In rezervatie mai traiesc 4 cerbi capatini, cerbi lopatari, capriori, vulpi, ursi, lupi si multe alte specii. In cadrul rezervatiei sunt incluse rezervatiile forestiere Codrii de Arama si Padurea de Argint ambele situate pe teritoriul comunei Agapia.